La constitución de la Biblioteca de la Facultad de Ingeniería fue un anhelo permanente desde el nacimiento de la carrera de Bioingeniería en 1984.

En sus primeros años funcionó en instalaciones del Instituto Superior de Informática de Entre Ríos (ISIPER), vecino a la Facultad de Ingeniería, sin por ello dejar de ser una inquietud constante el logro de espacio físico propio que albergara bibliografía, así como también una sala de lectura que permitiera el trabajo y estudio de los usuarios que así lo requirieran.

En 1992 y para honrar a quien tuvo un rol protagónico en la historia académica de Bioingeniería, se le impone el nombre de "Dr. Eduardo Alberto Barbagelata" (resol. CD 097/92), constituyéndose a partir de ese momento en la denominación oficial de esta unidad de información.

En la actualidad y desde 1996, la biblioteca ocupa la planta baja del edificio del Centro de Medios, ubicado en un predio equidistante a las Facultades de Ingeniería y Ciencias Agropecuarias.

El traslado de la sede facilitó la constitución de una biblioteca con estanterías de acceso libre, lo que significó un cambio significativo que facilitó aun más la interacción bibliografía-usuarios, tornándola así más accesible. Asimismo y a partir de fondos otorgados por proyectos a término, la biblioteca recibió equipamiento informático y mobiliario que le permitieron sostener procesos de actualización, tanto en sus procesos como en sus servicios.

A la fecha, se trabaja en la readecuación de los espacios, en vistas a sectorizar espacios de lectura; de trabajo informático; depósito de colecciones y administración, a los efectos de dotar de mayor calidad a la unidad de información.